Universitas Muhammadiyah Palangkaraya menyelenggarakan berbagai program pendidikan meliputi program sarjana, pascasarjana, profesi, dan diploma. Beberapa fakultas juga menyelenggarakan program sarjana maupun pascasarjana.
Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik
Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan
Fakultas Pertanian dan Kehutanan
Fakultas Teknik dan Informatika
Fakultas Agama Islam
Fakultas Ilmu Kesehatan